Америкийн эрдэмтэн Эрик С.Ландер 1996 онд дан нуклеотидын полиморфизмыг (SNP) 3-р үеийн молекулын маркер болгон албан ёсоор санал болгосны дараа SNP нь эдийн засгийн шинж чанарын холбоо тогтоох шинжилгээ, биологийн генетикийн холбоосын зураглал байгуулах, хүний ​​эмгэг төрүүлэгч генийн скрининг хийхэд өргөн хэрэглэгдэх болсон., Өвчний эрсдэлийг оношлох, урьдчилан таамаглах, эмийн хувийн үзлэг, биологийн болон анагаах ухааны судалгааны бусад салбарууд.Бэлэн ургацын үржүүлгийн салбарт SNP-ийг илрүүлэх нь шаардлагатай шинж чанаруудыг эрт сонгох боломжийг олгодог.Энэ сонголт нь өндөр нарийвчлалтай шинж чанартай бөгөөд морфологи, хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлсийн хөндлөнгийн оролцооноос үр дүнтэй зайлсхийж, улмаар үржлийн үйл явцыг ихээхэн богиносгодог.Тиймээс SNP нь суурь судалгааны салбарт асар их үүрэг гүйцэтгэдэг.

Нэг нуклеотидын полиморфизм (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) гэдэг нь ижил эсвэл өөр зүйлийн хувь хүмүүсийн ДНХ-ийн дараалалд ижил байрлалд нэг нуклеотидын ялгаа байх үзэгдлийг хэлдэг.Нэг суурийг оруулах, устгах, хөрвүүлэх, урвуу оруулах зэрэг нь энэ ялгааг үүсгэж болно.Өмнө нь SNP-ийн тодорхойлолт мутациас өөр байсан.Хувилбар локус нь SNP локус гэж тодорхойлохын тулд популяцийн аль нэг аллелийн давтамж 1% -иас их байхыг шаарддаг.Гэсэн хэдий ч орчин үеийн биологийн онолууд өргөжин тэлж, технологийн хэрэглээтэй холбоотойгоор аллелийн давтамж нь SNP-ийн тодорхойлолтыг хязгаарлахад зайлшгүй шаардлагатай нөхцөл байхаа больсон.Биотехнологийн мэдээллийн үндэсний төвийн (NCBI) нэг нуклеотидын полиморфизмын (dbSNP) мэдээллийн санд багтсан нэг нуклеотидын өөрчлөлтийн өгөгдлийн дагуу бага давтамжийн оруулах/устгах, микро хиймэл дагуулын өөрчлөлт гэх мэтийг мөн оруулсан болно.

Хүний биед SNP-ийн давтамж 0.1% байдаг.Өөрөөр хэлбэл, 1000 суурь хос тутамд дунджаар нэг SNP сайт байдаг.Хэдийгээр тохиолдлын давтамж харьцангуй өндөр байгаа ч бүх SNP сайтууд шинж чанаруудтай холбоотой нэр дэвшигчийн тэмдэглэгээ болж чаддаггүй.Энэ нь голчлон SNP үүсэх байршилтай холбоотой юм.

Онолын хувьд SNP нь геномын дарааллын аль ч хэсэгт тохиолдож болно.Кодлох бүсэд үүссэн SNP нь ижил утгатай мутаци ба ижил утгатай бус мутаци үүсгэдэг, өөрөөр хэлбэл амин хүчил нь мутацийн өмнө болон дараа өөрчлөгддөг эсвэл өөрчлөгддөггүй.Өөрчлөгдсөн амин хүчил нь ихэвчлэн пептидийн гинжин хэлхээг анхны функцээ алддаг (миссен мутаци), мөн орчуулгын тасалдал (утгагүй мутаци) үүсгэдэг.Кодлогдоогүй бүс нутаг болон ген хоорондын бүс нутагт үүсдэг SNP нь мРНХ-ийн залгаас, кодчилдоггүй РНХ-ийн дарааллын найрлага, транскрипцийн хүчин зүйл болон ДНХ-ийн холболтын үр дүнд нөлөөлж болно.Тодорхой харьцааг зурагт үзүүлэв:

SNP төрлүүд:

SNP бичих хэд хэдэн нийтлэг аргууд ба тэдгээрийн харьцуулалт

Янз бүрийн зарчмын дагуу SNP илрүүлэх нийтлэг аргуудыг дараах ангилалд хуваадаг.

Илрүүлэх аргуудын ангиллын харьцуулалт

Тайлбар: Хүснэгтэнд жагсаасан SNP илрүүлэх илүү түгээмэл аргуудыг одоогоор ашиглаж байгаа бөгөөд тодорхой талбайн гибридизаци (ASH), тусгай талбайн праймер өргөтгөл (ASPE), нэг суурь өргөтгөл (SBCE), тусгай талбайн зүсэлт (ASC), генийн чип технологи, масс спектрометрийн технологи гэх мэт илрүүлэх бусад аргуудыг ангилж, харьцуулаагүй болно.

Дээр дурдсан хэд хэдэн нийтлэг SNP илрүүлэх аргуудад нуклейн хүчлийг цэвэршүүлэх зардал, хугацаа нь зайлшгүй юм.Гэсэн хэдий ч Foregene-ийн шууд ПГУ-ын технологид суурилсан холбогдох иж бүрдэл нь цэвэршүүлээгүй дээжинд ПГУ эсвэл qPCR өсгөлтийг шууд хийх боломжтой бөгөөд энэ нь SNP илрүүлэхэд урьд өмнө байгаагүй хялбар байдлыг авчирдаг.

Foregene-ийн шууд ПГУ-ын цуврал бүтээгдэхүүн нь дээжийг цэвэршүүлэх алхмуудыг энгийн бөгөөд бүдүүлэг орхигдуулдаг бөгөөд энэ нь загвар бэлтгэхэд шаардагдах цаг хугацаа, зардлыг ихээхэн бууруулдаг.Өвөрмөц Taq полимераз нь олшруулах маш сайн чадвартай бөгөөд олшруулалтын нарийн төвөгтэй орчинд янз бүрийн дарангуйлагчдыг тэсвэрлэх чадвартай.Эдгээр шинж чанарууд нь өндөр бүтээмжтэй тусгай бүтээгдэхүүн авах техникийн баталгааг өгдөг. Foregene Direct PCR/qPCR иж бүрдэл нь төрөл бүрийн дээж, тухайлбал: амьтны эд (хархны сүүл, тахиа гэх мэт), ургамлын навч, үр (полисахарид ба полифенолын дээж орно) гэх мэт.